Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc9c1Q6UJY2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9c1Q6UJY2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms