Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cd300aQ6SJQ0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms