Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptx4Q6RUU0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptx4Q6RUU0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms