Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GcsamQ6RFH4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
GcsamQ6RFH4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms