Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vstm2lQ6PDS0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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