Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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