Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q6PD19 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q6PD19 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q6PD19 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q6PD19 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q6PD19 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q6PD19 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q6PD19 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q6PD19 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6PD19 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6PD19 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6PD19 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6PD19 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6PD19 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6PD19 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6PD19 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6PD19 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6PD19 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6PD19 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q6PD19 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6PD19 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6PD19 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6PD19 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6PD19 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6PD19 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6PD19 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q6PD19 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms