Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ttbk1Q6PCN3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttbk1Q6PCN3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms