Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cyp2d40Q6P8N9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms