Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hdac10Q6P3E7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdac10Q6P3E7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms