Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casc4Q6P2L7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casc4Q6P2L7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms