Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gpbp1Q6NXH3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gpbp1Q6NXH3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms