Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sp140Q6NSQ5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sp140Q6NSQ5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms