Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ8

Gm5414, MCG1050941, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5414Q6IFZ8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm5414Q6IFZ8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5414Q6IFZ8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms