Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt77Q6IFZ6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt77Q6IFZ6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms