Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Krt40Q6IFX3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt40Q6IFX3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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