Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hecw2Q6I6G8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hecw2Q6I6G8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms