Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KdsrQ6GV12 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KdsrQ6GV12 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms