Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nop58Q6DFW4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nop58Q6DFW4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms