Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pram1Q6BCL1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pram1Q6BCL1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms