Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp4fQ66X05 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms