Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp9cQ66X01 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms