Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnna3Q65CL1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna3Q65CL1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms