Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc18Q640L5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc18Q640L5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
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