Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Znf260Q62513 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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