Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vat1Q62465 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms