Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp4Q62445 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms