Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Sprr1bQ62267 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sprr1bQ62267 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms