Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpaQ62189 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms