Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sema3cQ62181 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3cQ62181 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms