Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Rbm38Q62176 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Rbm38Q62176 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Rbm38Q62176 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rbm38Q62176 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rbm38Q62176 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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