Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sin3bQ62141 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sin3bQ62141 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms