Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcbp2Q61990 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms