Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cd47Q61735 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd47Q61735 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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