Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxj1Q61660 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Foxj1Q61660 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Foxj1Q61660 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Foxj1Q61660 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxj1Q61660 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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