Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sox17Q61473 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sox17Q61473 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sox17Q61473 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sox17Q61473 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sox17Q61473 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Sox17Q61473 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox17Q61473 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox17Q61473 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox17Q61473 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox17Q61473 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox17Q61473 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sox17Q61473 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sox17Q61473 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sox17Q61473 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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