Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms