Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PcolceQ61398 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PcolceQ61398 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PcolceQ61398 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PcolceQ61398 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PcolceQ61398 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PcolceQ61398 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PcolceQ61398 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PcolceQ61398 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PcolceQ61398 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PcolceQ61398 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PcolceQ61398 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PcolceQ61398 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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