Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hif1aQ61221 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hif1aQ61221 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms