Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PapolaQ61183 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PapolaQ61183 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PapolaQ61183 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PapolaQ61183 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PapolaQ61183 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms