Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nab1Q61122 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms