Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rbbp4Q60972 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rbbp4Q60972 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rbbp4Q60972 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rbbp4Q60972 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbbp4Q60972 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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