Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Neurod1Q60867 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms