Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ripk1Q60855 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ripk1Q60855 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ripk1Q60855 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ripk1Q60855 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ripk1Q60855 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ripk1Q60855 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ripk1Q60855 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ripk1Q60855 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ripk1Q60855 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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