Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppp1r1bQ60829 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppp1r1bQ60829 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms