Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf3Q60803 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms