Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctf1Q60753 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms