Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Samhd1Q60710 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms