Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CttnQ60598 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms