Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sin3aQ60520 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms